三代微生物多样性在家畜研究中的应用

　　基于PacBio三代测序平台，高效获得16s rRNA全长序列。不必纠结引物选择带来的结果偏差，二代测序令物种分类更多更精准——到达“种”水平。今天分享的三篇文献是针对家畜微生态研究的内容，测序获得的全长序列在致病菌或肠菌动态变化分析中为文章锦上添花。
　　1、全长16S rRNA基因分析显示猪Yin-Dao微生物群分类多样性
　　本研究旨在比较子宫内膜炎母猪和健康母猪的Yin-Dao微生物群，并通过对16S rRNA基因的高通量测序来阐明子宫内膜炎母猪的Yin-Dao微生物群的重要变化。分别在中国广东(A农场)和云南省(B农场)的两个养猪场采集健康母猪(Healthy_A/B，n=10)和患病母猪(Endometritis_A/B，n=10)的Yin-Dao拭子，对样本进行二代扩增子测序(V3-V4)，针对A农场个别患病个体加测PacBio三代16S rRNA全长基因数据。
　　统计了两个农场健康母猪Yin-Dao内的核心微生物群，见Table 1。两个农场出现了两种子宫内膜炎微生物群模式：第一种主要由A农场的伯克霍尔德氏菌组成，第二种由B农场的细小单胞菌组成。通过对16S rRNA全长基因测序的分析，确定了3头子宫内膜炎母猪的Yin-Dao细菌群落组成。16SrRNA全长基因测序结果证实了V3-V4区测序结果中确实存在Burkholderia genus。

学习到了，之前一直没注意过这个点，受教了

说得很实在，没有夸大其词，这种真实分享太难得了

楼主辛苦了，整理这么多内容，必须点赞收藏